На відміну від сертифікатів з перевіркою домену, мультидоменні сертифікати захищають лише домени та субдомени, які вказуються при генеруванні сертифіката.

Наприклад, якщо при генеруванні сертифіката Comodo PositiveSSL ви вказали www.domain.com , то за умовчанням захищений також буде і domain.com.

Ситуація з мультидоменними сертифікатами інакша: якщо при генеруванні сертифіката ви вкажете www.domain.com, example.us та myworld.domain.net, то domain.com, www.example.us та www.myworld.domain.net захищені НЕ будуть. Будьте уважні, якщо вам необхідно захистити і domain.com, і www.domain.com, вкажіть обидва варіанти.